Τμήμα Μυκοβακτηριδίων: Στο τμήμα αυτό πραγματοποιούνται η απομόνωση, ταυτοποίηση και ο έλεγχος ευαισθησίας μυκοβακτηριδίων (μυκοβακτηριδίου της φυματίωσης και άτυπων μυκοβακτηριδίων) με την εφαρμογή φαινοτυπικών και μοριακών μεθόδων που περιλαμβάνουν ως επί το πλείστον μεθόδους αναφοράς, ταυτοποίηση  και έλεγχος ευαισθησίας στελεχών που  ανήκουν στο γένος Nocardia με τη χρήση μεθόδων αναφοράς