Τμήμα Διάγνωσης Αυτοάνοσων Νοσημάτων: Στο τμήμα αυτό πραγματοποιούνται εξετάσεις ανοσοφθορισμού, ανοσοαποτύπωσης και ELISA για αντιπυρηνικά αντισώματα (αντισώματα έναντι ιστονών, αντιγόνου Sm, μη ιστονικών πυρηνικών πρωτεϊνών nRNP, SSA/Ro και SSB/La, Scl-70, κεντρομεριδίου – ACA, Jo-1, dsDNA), αντικιτρουλλινικά, έναντι καρδιολιπίνης IgG/IgM, β2-γλυκοπρωτείνης 1 IgG/IgM, έναντι μυελοπεροξειδάσης, έναντι πρωτεϊνάσης PR3 και άλλα αντισώματα.